Впервые военная кафедра в Белорусском институте инженеров железнодорожного транспорта была создана в 1954 году и осуществляла подготовку офицеров запаса для органов военных сообщений до 1961 года. Руководил кафедрой полковник Шишковец К.В., участник Великой Отечественной войны, награжденный орденами "Красного Знамени", "Красной Звезды" и восемнадцатью медалями. Преподавательский состав кафедры состоял полностью из участников Великой Отечественной войны.
В сентябре 1972 года для подготовки офицерских кадров для Железнодорожных войск и органов военных сообщений в Белорусском институте инженеров железнодорожного транспорта вновь создается военная кафедра. Первыми преподавателями, которые прибыли вновь для формирования военной кафедры, были майоры Лисун А.И., Шерстнев В.М., подполковник Гордюк Г.М. Возглавил кафедру полковник Саурин Н.И.
В 1973 году кафедра пополняется опытными офицерами, которые внесли значимый вклад в создание учебно-материальной базы. Это майоры Фомичев В.И., Казаченко Н.И., Борисов А.А., Вашкевич В.К., Железко И.А.
В 1974 году начальником кафедры назначается полковник Петровец Н.Г. Из Вооруженных Сил прибывает большая группа офицеров: подполковник Кусакин И.В., майоры Дурило И.Ф., Илюхин Ф.И., капитаны Ефремов А.И., Михаленко М.В., Шейнин И.Г., Бобок И.М., Ильин В.Е., Мошкин С.Н., которые завершили создание военной кафедры как самостоятельного подразделения вуза.
В 1975 году создаются циклы: восстановление железных дорог, военных сообщений и общевойсковой курс.
В октябре 1983 года кафедру возглавляет полковник Байдак В.Г., награжденный орденами "Знак Почета" и "За службу Родине в ВС СССР". Под его руководством в июне 1986 года офицеры кафедры вместе с сотрудниками и студентами института принимали участие в ликвидации последствий аварии на Чернобыльской АЭС в Брагинском районе.
В 1987 году кафедра принимала активное участие в ликвидации последствий землетрясения в Армении. Руководил сводным строительным отрядом подполковник Судас М.А. В 80-е годы на военную кафедру пришло второе поколение преподавателей, заменивших уволенных в запас офицеров: подполковники Склярук А.А., Веселых С.В., Комаревич А.Н., майоры Зенченков В.А., Смирнов В.Н., Литвинов В.М., Чижик Л.Н., капитан Комаров В.Я.
В 1992 году начальником кафедры назначается полковник Левтринский В.В. Основу преподавательского состава кафедры составляют ее бывшие выпускники, опытные педагоги и воспитатели: полковники Кирик В.Н., Смирнов В.Н., Стефанович Е.И., Фещенко А.П., подполковник Яроцкий С.Д. Учебную часть кафедры поочередно возглавляли полковники Гордюк Г.М., Штанько А.Ф., Даугирдас А.Т., Кирик В.Н., начальниками циклов были полковники Кусакин И.В., Марийко Н.С., Редькин А.В., Казаченко Н.И., подполковник Чижик Л.Н.
В июне 2003 года военная кафедра реорганизуется в военно-транспортный факультет учреждения образования "Белорусский государственный университет транспорта". Начальником факультета назначается полковник Левтринский В.В., а его заместителями – офицеры военной кафедры: полковники Кирик В.Н. и Стефанович Е.И. В составе факультета сохраняется военная кафедра, которая является основным структурным подразделением, предназначенным для проведения учебной, методической, научной и воспитательной работы. Начальником кафедры назначается полковник Палто П.В. В сентябре 2004 года кафедра переименовывается в кафедру специальной подготовки. Преподавательский состав кафедры пополняется молодыми и перспективными офицерами. Это майоры Демидов П.Г., Девятко О.В., подполковники Махаев К.В., Квасов С.Н.
В августе 2006 года начальником кафедры специальной подготовки назначается полковник Фещенко А.П.
В сентябре 2007 года кафедра специальной подготовки переименовывается в кафедру военно-специальной подготовки и в ее составе создаются два цикла: восстановления путей сообщения и транспортно-технический. Профессорско-преподавательский состав кафедры пополняется энергичными и инициативными офицерами. Это полковники Куксо А.М., Бортновский А.А., подполковники Кучинский Э.П., Коломиец А.В., Невжинский В.А., Короленок Т.С., Будыко О.А.
В 2008-2009 годах на кафедру прибывает большая группа офицеров: полковники Бобрицкий С.М., Юрасюк Н.И., подполковники Гуринович В.И, Цивилёв А.А., Дейкун В.И., Козлов М.Г., Кирик С.В. и полковник Поддубный А.А., который в 2011 году назначается начальником военно-транспортного факультета.
В июне 2010 года начальником кафедры военно-специальной подготовки назначается полковник Гордюк А.Г.
В мае 2015 года начальником кафедры назначен кандидат военных наук, полковник Бобрицкий С.М.
Начальниками циклов с 2007 года поочередно были подполковники Квасов С.Н, Яроцкий С.Д, Коломиец А.В., Демидов П.Г., Кучинский Э.П., Махаев К.В., Короленок Т.С., Максименко С.В. В настоящее время подполковник Томашов В.В.
Прафесарска-выкладчыцкім складам ваеннай кафедры выконваецца вялікая і плённая навуковая работа, якая заключаецца ў правядзенні навуковых даследаванняў, удзеле ў рознага роду навуковых канферэнцыях і семінарах, падрыхтоўцы навуковых работнікаў вышэйшай кваліфікацыі, а таксама ў прыцягненні курсантаў і студэнтаў у даследчую работу праз навукова-даследчыя гурткі.
Прафесарска-выкладчыцкім складам распрацаваны наступныя НДР:
1. "Удасканаленне камплектаў механізаванай прылады для механізацыі работ пры будаўніцтве, рэканструкцыі і рамонце чыгуначных шляхоў", 2007 год (кіраўнік: п-к Леўтрынскi В.В., выканаўцы: м-р Дзямідаў П.Р., п/п-к Квасаў С.Н.).
2. "Распрацоўка Інструкцыі па інвентарызацыі аб'ектаў тэхнічнага прыкрыцця чыгунак рэгіёну", 2007 год. Праца выканана ў адпаведнасці з праграмай Саюзнай дзяржавы "Стварэнне адзінай сістэмы тэхнічнага прыкрыцця чыгунак рэгіёну" сумесна з ДТрЗ МА РБ (кіраўнік: Леўтрынскi В.В., выканаўцы: м-р Дзямідаў П.Р., п-к Палто П.У.).
3. "Распрацоўка Інструкцыі па доўгаму захоўванню матэрыяльных каштоўнасцяў мабілізацыйнага рэзерву ў арганізацыях Беларускай чыгункі", 2009 год. Праца выканана па заказу Беларускай чыгункі (кіраўнік: п-к Леўтрынскi В.В., выканаўцы: п-к Гардзюк А.Р., м-р Дзямідаў П.Р., п/п-к Квасаў С.Н.).
4. "Вывучэнне існуючай сітуацыі ў раёне чыгуначнага моста ў а.п. Клёнки", 2009 год. Праца выконвалася па заказу Беларускай чыгункі (кіраўнік: п-к Леўтрынскi В.В., выканаўцы п-к Фешчанка А.П., м-р Дзямідаў П.Р.).
5. "Аналіз апорнай здольнасці разрэзных пралётных будынкаў маёмасці НЖМ-56 пад сучасныя цягніковая нагрузкі", 2011 год. Праца выконвалася ў рамках дысертацыйных даследаванняў старэйшага выкладчыка падпалкоўніка Махаева К.У. (Кіраўнік: п-к Гардзюк А.Р., адк. выканаўца: п/п-к Махаеў К.У.).
6. "Распрацоўка матэматычнага забеспячэння для планавання камбінаваных воінскіх перавозак з выкарыстаннем геаінфармацыйных сістэм", 2011 год. Праца выконвалася ў рамках дысертацыйных даследаванняў начальніка цыкла маёра Дзямідава П.Г. (Кіраўнік: п-к Гардзюк А.Р., адк. выканаўца: м-р Дзямідаў П.Р.).
7. "Удасканаленне сістэмы тэхнічнага прыкрыцця чыгунак", 2011 год (кіраўнік: п-к Гардзюк А.Р., адк. выканаўца п/п-к Каламіец А.В.).
8. "Распрацоўка комплекснай аўтаматызаванай сістэмы (КАС) для навучання курсантаў і студэнтаў па спецыяльнай падрыхтоўцы пуцявых падраздзяленняў транспартных войскаў", 2011 год (кіраўнік: п-к Гардзюк А.Р., адк. выканаўца п/п-к запасу Яроцкі С. Д.).
9. "Распрацоўка тэхнічных умоў пагрузкі і мацавання табельнай маёмасці РЭМ-500", 2012 год. Праца выканана па заказу ДТрЗ (кіраўнік: п-к Гардзюк А.Р., адк. выканаўца Няўжынскi В.А.).
10. "Распрацоўка комплекснай сістэмы электразабеспячэння мабільных і аддаленых спажыўцоў пры правядзенні падраздзяленнямі транспартных войскаў вучэбна-практычных заняткаў на аб'ектах чыгуначнага транспарту", 2013 г. (Кіраўнік: п-к Гардзюк А.Р., адк. выканаўца: п/п-к Каралёнак Т.С.).
11. "Распрацоўка методыкі адаптацыі арганізацыйна-штатнай структуры асобнага чыгуначнага батальёна механізавання транспартных войскаў да дзеянняў у сучасных аперацыях", заканчэнне 2013 г. (Кіраўнік: п-к Гардзюк А.Р., адк. выканаўца: п/п-к Гурыновіч В.І.).
У інтарэсах Дэпартамента транспартнага забеспячэння Міністэрства абароны і ў інтарэсах ваенна-транспартнага факультэта на кафедры выкананы 14 навукова-даследчых работ.
Падрыхтоўка навуковых работнікаў вышэйшай кваліфікацыі на кафедры праводзіцца ў адпаведнасці з патрабаваннямі нарматыўных прававых актаў Міністэрства абароны і Міністэрства адукацыі Рэспублікі Беларусь.
Сярод прафесарска-выкладчыцкага складу кафедры ступень магістра тэхнічных навук маюць 6 афіцэраў: п/п-к Бабрыцкі С.М. (2008 г.), п/п-к Казлоў М. Г. (2011 г.), п/п-к Кірык С.У. (2012 г.), п/п-к Гурыновіч В. І. (2013 г.), м-р Даламанюк (2015 г.). Навучанне ў завочнай аспірантуры пры УА "БелДУТ" прайшлі: п/п-к Махаеў К.У. (2010), п/п-к Каралёнак Т.С. (2014 г.).
У цяперашні час праходзяць навучанне ў аспірантуры завочнай формы навучання пры БелДУТ 4 афіцэра: п/п-к Казлоў М.Г., м-р Кірык С.У., к-н Петрусевіч В.У. Такая сур'ёзная праца не магла не даць свой плён і, як вынік, у 2012 годзе ў выніку навучання ў вочнай ад'юнктуры пры ваенна-транспартным універсітэце чыгуначных войскаў МО РФ г. Санкт-Пецярбург падпалкоўнік Бабрыцкі С. М. абараніў кандыдацкую дысертацыю і атрымаў навуковую ступень кандыдата ваенных навук.
На кафедры вядзецца вялікая праца па ўдзеле прафесарска-выкладчыцкага складу, курсантаў і студэнтаў у Міжнародных, Рэспубліканскіх і ўніверсітэцкіх навуковых канферэнцыях і семінарах. Традыцыяй стала штогадовае правядзенне кафедрай міжнароднай навукова-практычнай канферэнцыі, прысвечанай праблемам будаўніцтва і аднаўлення штучных збудаванняў.
Па выніках праведзеных канферэнцый выдаюцца зборнікі тэзісаў дакладаў. Вялікая работа праводзіцца на кафедры па распрацоўцы і ўкараненню ў навучальны працэс камп'ютэрных праграм і электронных падручнікаў (кафедрай выкарыстоўваецца 49 тэстуючых, 33 навучальных праграмы і 68 электронных падручнікаў). Вядзецца праца па забеспячэнні выкладаемых навучальных дысцыплін вучэбнымі выданнямі (падручнікамі, вучэбнымі і вучэбна-метадычнымі дапаможнікамі). Па заказу Дэпартамента транспартнага забеспячэння распрацаваны: "Падручнік сяржанта транспартных войскаў. Частка 2. Тактыка-спецыяльная, спецыяльная і тэхнічная падрыхтоўка чыгуначных падраздзяленняў", "Частка 3. Тактыка-спецыяльная, спецыяльная і тэхнічная падрыхтоўка дарожна-маставых падраздзяленняў". За час існавання кафедры «Ваенна-спецыяльная падрыхтоўка» у мэтах якаснай падрыхтоўкі курсантаў і студэнтаў калектывам кафедры зроблена вялікая праца па стварэнні і ўдасканаленні вучэбна-матэрыяльнай базы.
З 1992 г. у пасёлку Перамога дзейнiчае палявы навучальны цэнтр, якi ўключае 27 навучальных месцаў у 2 спецыялізаваных класах, якія дазваляюць фармаваць практычныя навыкі і ўменні ва ўсіх катэгорый навучэнцаў. У навучальным корпусе БелДУТ створаны і паспяхова функцыянуюць 6 спецыялізаваных аўдыторый па дысцыплінах навучання (клас аднаўлення чыгуначных мастоў, клас дарожнай падрыхтоўкі, клас воінскіх чыгуначных перавозак, клас спецыяльнай тэхнікі транспартных войскаў, пуцявы клас, клас сувязі). Усе спецыялізаваныя аўдыторыі абсталяваны стэндамі, макетамі, нагляднымi дапаможнікамі, тэхнічнымі сродкамі навучання.
У цяперашні час кафедра выкарыстоўвае ў навучальным працэсе 35 навучальных і 2 віртуальных трэнажора, камп'ютэрны клас, абсталяваны інтэрактыўнай дошкай і 9 ПЭВМ. Значны ўклад у развіццё вучэбна-матэрыяльнай базы робіцца курсантамі і студэнтамі. Пад кіраўніцтвам выкладчыкаў кафедры імі распрацаваны і ўкаранёны ў навучальны працэс віртуальныя трэнажоры, такія як сімулятар радыёстанцыі УКХ дыяпазону Р-159 і КШМ Р-142Н. Для вывучэння дысцыплін, якія выкладаюцца на кафедры, бібліятэка факультэта мае спецыялізаваную літаратуру. Для якаснай падрыхтоўкі спецыялістаў транспартных войскаў вядзецца актыўнае супрацоўніцтва з кафедрамі іншых ваенных факультэтаў Рэспублікі Беларусь, Ваеннай акадэміі Рэспублікі Беларусь, Ваенна-транспартнага універсітэта чыгуначных войскаў г. Санкт-Пецярбург.
Створаная матэрыяльна-тэхнічная база забяспечвае якаснае правядзенне навучальнага працэсу, падрыхтоўку кадравых афіцэраў, афіцэраў запасу і малодшых камандзіраў для транспартных войскаў Рэспублікі Беларусь.
Кафедра «Ваенна-спецыяльная падрыхтоўка» з'яўляецца выпускаючай кафедрай і ажыццяўляе падрыхтоўку кадравых афіцэраў для транспартных войскаў Рэспублікі Беларусь па спецыяльнасці "Кіраванне падраздзяленнямі транспартных войскаў" па чатырох напрамках спецыяльнасці і трох спецыялізацыях, а таксама ажыццяўляе падрыхтоўку студэнтаў па васьмі ваенна-ўліковых спецыяльнасцях малодшых камандзіраў і па пяці ваенна-ўліковых спецыяльнасцях афіцэраў запасу.
На кафедры выкладаецца 36 навучальных дысцыплін: 19 для курсантаў, 6 для афіцэраў запасу, 10 для малодшых камандзіраў. За перыяд з 1974 па 2003 гады кафедрай падрыхтавана каля 6 тысяч афіцэраў запасу. За перыяд з 2004 года па цяперашні час падрыхтавана больш за 500 афіцэраў запасу і 800 малодшых камандзіраў. Першы выпуск кадравых афіцэраў адбыўся ў 2008 годзе, усяго выпушчана 95 афіцэраў.
Прафесарска-выкладчыцкім складам кафедры «Ваенна-спецыяльная падрыхтоўка» выконваецца вялікая і плённая навуковая работа, якая заключаецца ў правядзенні навуковых даследаванняў, удзеле ў рознага роду навуковых канферэнцыях і семінарах, падрыхтоўцы навуковых работнікаў вышэйшай кваліфікацыі, а таксама ў прыцягненні курсантаў і студэнтаў у даследчую работу праз навукова-даследчыя гурткі.